文/ 仲恺农业工程学院动物科技学院院长、广东省水产疫病监测与综合防控共性关键技术创新团队首席科学家、广东省水生动物卫生协会会长 林蠡
仲恺农业工程学院动物科技学院院长、广东省水产疫病监测与综合防控共性关键技术创新团队首席科学家、广东省水生动物卫生协会会长 林蠡
2020年2月26日，湖北医药学院（Hubei University of Medicine）刘龙课题组联合暨南大学（Jinan University）吴建国课题组（他们两人是共同通讯作者）在 J Med Virol《医学病毒学杂志》上发表论文“Composition and divergence of coronavirus spike proteins and host ACE2 receptors predict potential intermediate hosts of SARS-CoV-2” 中文翻译是：【冠状病毒刺突蛋白和宿主血管紧张素转换酶2（ACE2）受体的组成和分化预测新型冠状病毒（SARS-CoV-2）潜在的中间宿主】。
网络上文章信息截图如下：
↓↓↓
↓↓↓
图1、网络上文章信息截图
下面我剖析一下这篇文章的主要结果：
↓↓↓
↓↓↓
在摘要（Abstract）没有画红线部分主要是讲述研究背景和意义。红线部分是主要结果。红线部分翻译如下：在这个研究，我们系统地比较冠状病毒刺突蛋白和宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合的结构域。刺突蛋白和宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合的关键氨基酸表明穿山甲、蛇和龟鳖类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）可能是人类SARS-CoV-2病毒的中间宿主。
文章的结果主要来自下表的冠状病毒刺突蛋白和宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合的结构域氨基酸比较：
↓↓↓
↓↓↓
图2、不同动物ACE2蛋白和新型冠状病毒（SARS-CoV-2）结合结构域的氨基酸序列比对
根据上述结果，作者的主要描述见下面红色部分
↓↓↓
↓↓↓
红色部分中文翻译如下：在龟鳖类（西部锦龟、绿海龟、中华鳖）穿山甲和蝙蝠类的这个结构域和理论上可以感染的物种，比如人类、大猩猩和猕猴有5个以上的差异。小鼠和狗的突变多个5个氨基酸，猫和仓鼠只是有3个突变。
在讨论这篇文章结果之前，我们先讨论下穿山甲是否为新型冠状病毒的中间宿主？根据目前学术界的观点，穿山甲冠状病毒的全基因组和新型冠状病毒的全基因组只有90.3%的相似度，穿山甲不是新型冠状病毒的中间宿主。
基于上述主要结果，可以得出以下几点：
1. 文章作者只是采用采用生物信息学工具去分析网络下载的序列。结果只是一种预测，没有必须的实验结果支撑。如何解读生物信息结果，需要非常谨慎。
2. 作者没有从龟鳖类上分离到任何冠状病毒。其实至今为止，全世界在龟鳖类还没有冠状病毒报道的先例。就算分离到冠状病毒，作者还要对分离到的病毒株进行全基因组测序，在核苷酸序列上和SARS-CoV-2病毒全基因组有非常高度（99%以上）的相似度，才能下现在的结论。
3. 病毒感染一个宿主，其生活史为：附着、入侵、脱壳、转录、复制、翻译、组装和释放 8个关键环节。任何一个环节出问题都会导致病毒感染的失败。冠状病毒刺突蛋白和宿主受体血管紧张素转换酶2（ACE2）结合，只是涉及到病毒的入侵环节。而且作者也承认龟鳖类与人类的血管紧张素转换酶2（ACE2）和冠状病毒结合的结构域还存在5个氨基酸的差异。因此，病毒能否进入龟鳖类细胞还是疑问。就算进入细胞，还要龟鳖类细胞支撑病毒的脱壳、转录、复制、翻译、组装和释放 6个关键环节。此外，病毒复制需要一定的温度范围，龟鳖类是变温动物，人类是恒温动物。龟鳖类很难在人的正常体温（36摄氏度）下存活。
4. 文章作者充分利用穿山甲是中间宿主这个结果来支撑他们的预测。穿山甲是哺乳动物，龟鳖类是爬行动物。在分类上，穿山甲比龟鳖类更加接近人类，现在连穿山甲都不是新型冠状病毒的中间宿主，龟鳖类就更加不可能了。
综上所述，可以看出，龟鳖类不可能是新型冠状病毒的中间宿主，湖北医药学院和暨南大学团队的结论缺乏基本的科学依据。
